ウインドエアコン（窓用エアコン）を取り付けた場合、使用していないときは、窓を閉めることはできますか？

窓の開閉、施錠は可能です。

窓の構造によっては、右側据付けで戸締りができない場合があります。右側設置の場合は戸側・柱側パッキンの差し替え、窓ストッパーの付け替えが必要になります。